Align pdb1.pdb 496 with pdb2.pdb 750
Twists 1 ini-len 312 ini-rmsd 4.51 opt-equ 402 opt-rmsd 3.23 chain-rmsd 4.88 Score 472.12 align-len 626 gaps 224 (35.78%)
P-value 1.67e-06 Afp-num 117005 Identity 10.06% Similarity 21.09%
Block  0 afp 27 score 366.16 rmsd  3.33 gap 210 (0.49%)
Block  1 afp 12 score 110.76 rmsd  3.69 gap 77 (0.45%)

                  .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
Chain 1:    5 NTQQGRTSIVHLFEW---------------RWVDIALECERYLAPKGFGGVQVSPPNENVAIH-------
              111  1111111111               111111111 11111111111111111111111       
Chain 2:  173 TRAQKDDVIYEVHVRGFTEQDTSIPAQYRGTYYGAGLKA-SYLASLGVTAVEFLPVQETQNDANDVVPNS

                  .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
Chain 1:   53 NPFRPWWERYQPVSY-KLCTRSG-------NEDEFRNMVTRCNNVGVRIYVDAVINHMCGNAVSAGTSST
              1111111 1111111 1111111       11111111111111111111111111111111        
Chain 2:  242 DANQNYW-GYMTENYFSPDRRYAYNKAAGGPTAEFQAMVQAFHNAGIKVYMDVVYNHTAEGGTWTSSDPT

                  .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
Chain 1:  115 CGSYFNPGSRDFPAVPYSGWDFNDGKCKTGSGDIENYNDATQVRDCRLSGLLDLALGKDYVRSKIAEYMN
                     111111  11111111111   111             1111111111111111111111111
Chain 2:  311 T------ATIYSWRGLDNATYYELTSGNQYFY-------------DNTGIGANFNTYNTVAQNLIVDSLA

                  .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
Chain 1:  185 HLID-IGVAGFRIDASKHMWP---------------------------GDIKAILDKLHNLNSNWFPEGS
              1111 1111111111111111                           1111111111111    1   1
Chain 2:  362 YWANTMGVDGFRFDLASVLGNSCLNGAYTASAPNCPNGGYNFDAADSNVAINRILREFTVRPAAGG---S

                  .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
Chain 1:  227 KPFIYQEVIDLGGEPIKSSDYFGNGRVTEFKYGAKLGTVIRKWNGEKMSY--LKNWGEGWGFMP------
              111111111    111111111111111111111111111111111   1  111111 11111      
Chain 2:  429 GLDLFAEPWAIGGNSYQLGGFPQGWSEWNGLFRDSLRQAQNELGSMTIYVTQDANDFSGSSNLFQSSGRS

                  .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
Chain 1:  289 SDRALVFVDNHDNQRG---------------------HGAGGASILTFW----------DARLYKMAVGF
              111111111111111                      111111111             11111111111
Chain 2:  499 PWNSINFIDVHDGMTLKDVYSCNGANNSQAWPYGPSDGGTSTNYSWDQGMSAGTGAAVDQRRAARTGMAF

                  .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
Chain 1:  328 MLAHPYGFTRVMSSY---RWPRYFENGKDVNDWVGPPNDNGVTKEVTINPDTTCGNDWVCEHRWRQIRNM
              11111 11111111    222222    222222222     222222222 2         22222222
Chain 2:  569 EMLSA-GTPLMQGGDEYLRTLQCN----NNAYNLDSSAN---WLTYSWTTDQSN--------FYTFAQRL

                  .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
Chain 1:  395 VNFRNVVDGQ--------PFTNWYDN-------------GSNQVAFGRGN-------RGFIVFNNDDWTF
              2222222222        22222222             22222222222       2222222222222
Chain 2:  623 IAFRKAHPALRPSSWYSGSQLTWYQPSGAVADSNYWNNTSNYAIAYAINGPSLGDSNSIYVAYNGWSSSV

                  .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .
Chain 1:  437 SLTLQ-TGLPAGTYCDVI---------SGDKINGNCTGIKIYVSDDGKAHFSISNSAEDPFIAIHA
              22222 222222222222         222222222   2222   2222222222   2222222
Chain 2:  693 TFTLPAPPSGTQWYRVTDTCDWNDGASTFVAPGSET---LIGG---AGTTYGQCGQ---SLLLLIS

Note: positions are from PDB; the numbers between alignments are block index